「熊本県内にフリースクールはどれくらいあるの?」
「住んでいる市に通える場所はある?」
「月謝や補助金、出席扱いはどうなるの?」
そんな不安を感じている保護者の方も少なくありません。
熊本県では、不登校支援やフリースクールの状況が市町村ごとに大きく異なります。
熊本市にはフリースクールや支援教室が22校と集中していますが、県北・阿蘇地域などの一部では1校のみの地域もあり、選択肢が限られている場合があります。
また、利用料への補助金制度については、熊本市を除く市町村を対象に、前期・後期それぞれ上限2万円の補助制度が設けられています。
このページでは、熊本県内で確認できているフリースクール44校の情報をもとに、
- 熊本県全体の不登校支援の特徴と市町村別の詳細ページへの案内
- フリースクールの数や地域ごとの傾向
- 相談窓口・出席扱いの実績について
- 費用の目安(月2万〜6.9万円)、補助金・助成制度
などまで詳しくまとめています。
まずはこのページで熊本県全体の状況を把握し、お住まいの地域やお子さんの状況に合った居場所を探すための参考にしてください。
【ひかりすまいる編集部】

全国47都道府県・792市町村を対象に、フリースクールや不登校支援制度の情報を調査・掲載しています。
- 対応エリア: 全国47都道府県・792市町村
- 掲載データ: 全国3,526校以上(支援教室・オンライン含む)
- 専門項目: 補助金申請 / 出席扱い制度 / 行政相談 / オンライン学習
各自治体・施設の公式情報をもとに、編集部が内容を確認・整理したうえで掲載しています。
熊本県内における不登校の現状(2026年)

全国的に、不登校の児童生徒数は年々増加傾向にあります。
この傾向は特定の地域に限ったものではなく、熊本県においても少しずつ状況が変化しています。
ここでは、行政が公表しているデータをもとに、県内における不登校の推移を整理していきます。
熊本県の不登校人数の推移(2022年〜2024年度)
熊本県内でも、不登校児童生徒数は増加傾向が続いており、直近3年間で過去最多水準となっています。
政府統計の総合窓口(e-Stat)に掲載されている、文部科学省提供の最新調査データによると、熊本県内の小・中・高校における不登校児童生徒数は、令和6年度(2024年度)に4,830人に達しました。

対象:国公私立/年度:2022〜2024年度
(出典:政府統計の総合窓口(e-Stat)「児童生徒の問題行動・不登校等生徒指導上の諸課題に関する調査(政府統計コード00400304)」より作成(提供:文部科学省))
- 全体の推移: 2022年度から2024年度にかけて、不登校児童生徒数は3,950人から4,830人へと880人増加しており、3年間で約22%増加しています。
- 中学生の増加が顕著:特に中学生の不登校が顕著で、2022年度の2,320人から2024年度には2,980人へと660人増加し、全体の増加の75%を占めています。
- 中学生の不登校数が最も多い傾向: 各年度において中学生の不登校数が全体の約6割を占めており、小学生・高校生と比較して2倍以上の高い数値で推移しています。
熊本県における不登校児童生徒数は継続的に増加しており、特に中学生の不登校が深刻な状況にあります。
中学生期における包括的な支援体制の構築が重要な課題となっています。
【重要】熊本県の不登校支援サポート体制(12市)

不登校のお子さんやご家庭を支援するために、熊本県では行政が中心となっていくつかの取り組みを行っています。
ここでは代表的な公的な支援についてご紹介します。
不登校支援センター「フレンドリー」
熊本県では、不登校の状態にある子どもの社会的な自立を支援する場として、教育支援センター「フレンドリー」を設置しています。
熊本市内に複数の教室が設けられ、活動の場として運営されています。
センターの概要
・運営主体:県
・名称:教育支援センター「フレンドリー」
・教室数:熊本市内に6教室
・所在地:あいぱる大江教室、火の君教室、植木教室、新町教室、託麻教室、森都心教室
・費用:原則無料(活動により実費が必要な場合あり)
センターでの過ごし方
このセンターでは、教室ごとに定められた曜日・時間に活動が行われています。
活動内容として、スポーツ、読書、仲間づくり、ものづくり、教科学習、所外体験活動などが実施されています。
活動日や時間、内容は教室ごとに異なります。
社会的自立支援
不登校の未然防止や早期の支援を重視し、児童生徒一人ひとりの状況に応じた取組が進められています。
未然防止の取組
安全で安心な居場所づくりの推進が行われています。
- 学校の風土づくりや生活アンケート、教育相談の実施が行われています。
- 1人1台端末を活用した「心の健康観察」や「SOSの出し方に関する教育」が実施されています。
- SC・SSW等の専門家との連携が行われています。
初期対応の取組
不登校の兆しが見られる段階での対応が示されています。
- 「愛の1・2・3運動+1」による家庭訪問や電話連絡が行われています。
- 学校内外の専門機関と連携した支援が実施されています。
- 不登校支援シート等を活用した情報共有が行われています。
自立支援の取組
県の取組として、継続的な学びや社会的自立を支える支援が実施されています。
- 校内教育支援センターや教育支援センターの活用が行われています。
- 民間施設等との連携やICTを活用した学習支援が実施されています。
相談窓口
熊本県による相談窓口は以下となります。
熊本県子ども・若者総合相談センター
学校に通うことが難しい状況にある子どもや、その背景に家庭内でのケアを担う事情があるケースなどに対応する相談窓口です。
このセンターでは、複数の相談手段を通じて相談を受け付けています。
電話相談:096-384-1000 月曜日~金曜日 8時30分~17時00分
来所相談:月曜日~金曜日 9時00分~17時00分
SNS相談:毎週木曜日(祝日を除く)10時00分~15時00分
(出典:https://kowaka-cocon.jp/youngcarer/)
熊本県市ごとの不登校支援(12市)
なお、熊本県では県公式サイトにて、学校外の学びの場として「フリースクール等民間団体」の情報も案内されています。
(出典:https://www.city.kumamoto.jp/kiji00343800/index.html)
ただし、県ページの掲載団体は一部に限られています。
本記事では、県公式情報も確認したうえで、各団体の公式サイトや所在地情報を1件ずつ調査し、熊本県内のフリースクール等を市ごとに整理しています。
※掲載しているフリースクール数は、通学型フリースクールに加え、教育支援センター(適応指導教室)、民間団体、NPO等の「学校以外の学び・居場所」を含めた数です。
自治体や運営形態によって呼称・位置づけが異なるため、本ページでは保護者の方が実際に利用を検討できる支援先を総合的に整理しています。
| 熊本県一覧 | 不登校支援 |
|---|---|
| 熊本市 | 補助金:なし フリースクール22校 出席扱い:あり >>熊本市不登校詳細はこちら |
| 八代市 | 補助金:あり フリースクール2校 出席扱い:あり >>八代市不登校詳細はこちら |
| 天草市 | 補助金:あり フリースクール3校 出席扱い:あり >>天草市不登校詳細はこちら |
| 玉名市 | 補助金:あり フリースクール2校 出席扱い:あり >>玉名市不登校詳細はこちら |
| 山鹿市 | 補助金:あり フリースクール2校 出席扱い:実績未確認 >>山鹿市不登校詳細はこちら |
| 菊池市 | 補助金:あり フリースクール1校 出席扱い:実績未確認 >>菊池市不登校詳細はこちら |
| 荒尾市 | 補助金:あり フリースクール3校 出席扱い:あり >>荒尾市不登校詳細はこちら |
| 合志市 | 補助金:あり フリースクール1校 出席扱い:実績未確認 >>合志市不登校詳細はこちら |
| 宇土市 | 補助金:あり フリースクール2校 出席扱い:実績未確認 >>宇土市不登校詳細はこちら |
| 人吉市 | 補助金:あり フリースクール3校 出席扱い:あり >>人吉市不登校詳細はこちら |
| 水俣市 | 補助金:あり フリースクール2校 出席扱い:実績未確認 >>水俣市不登校詳細はこちら |
| 阿蘇市 | 補助金:あり フリースクール1校 出席扱い:実績未確認 >>阿蘇市不登校詳細はこちら |
※掲載情報は、熊本県・市町村・各団体の公式発信をもとに確認し、ひかりすまいる編集部にて整理・調査しています。
(最終確認:2026年1月時点)
【市町村別】熊本県のフリースクール全44校一覧

こちらでは熊本県内にあるフリースクールを市町村ごとにまとめています。
※校数は、通学型のフリースクールを基準に掲載しています。
熊本市(22校)
- フリースクール地球子屋
- 青山教室(くまもと学習支援ネットワーク)
- WING SCHOOL
- ARK(アーク)
- ARK(アーク)セカンド
- e.a.o.チャイルズコミュニケーションスクール
- ガット教室
- ゼロスクール 錦ヶ丘分校
- アークイノベーションスクール Noah
- YMCA ぷらっとほーむ
- 熊本学習支援センター
- 第一学院中等部 熊本キャンパス
- くまもと中央高等学院
- こどもデイケア
- 星槎国際高等学校 熊本キャンパス フリースクール「ジオスクール」
- オルタナティブスクールCHITTA
- 勇志国際高等学校 中等部 熊本学習センター
- トライ式中等部 熊本駅前キャンパス
- 熊本インターナショナルスクール
- 九州ルーテル学院 インターナショナルスクール小学部
- 一ッ葉高等学校中等部 熊本キャンパス
- フリースクール「夢学舎熊本校」
八代市(2校)
- 八代市教育支援センター「くま川教室」
- 志成館高等学院 八代校
天草市(3校)
- いこいスペース∞こあ まるちゃん家
- カワセミ学級
- このいろフリースクール
玉名市(2校)
- タマにゃん教室
- 子どもの第3の場「でぃんぐる(DingЯ)」
山鹿市(2校)
- 山鹿市教育支援センター
- 天才合宿+(プラス)
菊池市(1校)
- 菊池市教育支援センター
荒尾市(3校)
- ハートフルルーム
- 小岱教室(しょうだいきょうしつ)
- 熊本個別指導教室
合志市(1校)
- フリースクール&サポート校 くまもと学院
宇土市(2校)
- ほっとスペース
- ブレイクスルー・アカデミー
人吉市(3校)
- 教育支援センター かがやき教室
- 志成館高等学院 人吉キャンパス
- フリースクール「夢学舎熊本校」
水俣市(2校)
- 水俣市子ども自立支援室
- オリーブ 地域の縁がわ
阿蘇市(1校)
- ナチュラル・スクール栞の里
※現在、熊本県内の「宇城市・上天草市」では、フリースクールなどの支援校は確認されていません。
※本ページは作成時点の情報のため、最新情報は各市町村の公式サイト等でご確認ください。
熊本県内には44校のフリースクール・支援教室がある
熊本県内には、確認できているだけでも44校のフリースクール・教育支援センターなどの不登校支援拠点があります。
特に政令指定都市である熊本市を中心に選択肢が広がっており、学習支援型・居場所型・インターナショナルスクールなど、支援の形も多様です。
一方で、地域によっては通学圏内に選択肢が少ないケースも見られ、居住エリアによる差が生じているのが現状です。
そうした中、近年はオンライン型の学習支援や相談支援を併用する家庭も増えています。
フリースクールの数は熊本市に集中している
地域別に見ると、熊本市が22校と県内で最も多く、全体の約半数を占めています。
次いで、天草市・荒尾市が各3校と比較的選択肢が多い地域となっています。
そのほか、八代市・玉名市・山鹿市・宇土市・水俣市では各2校、菊池市・合志市・阿蘇市では1校のみとなっており、支援校が限られているエリアも少なくありません。
また、宇城市・上天草市ではフリースクール等が確認されていないなど、地域間の支援体制には明確な差が見られます。
地域に左右されない不登校支援を実現するオンライン型
熊本県のように都市部と中山間地域・沿岸地域が混在するエリアでは、「通える範囲にフリースクールがない」という課題が起こりやすくなります。
こうした状況に対し、オンラインによる学習支援・居場所支援・保護者相談を活用することで、地域に関係なく支援につながる選択肢も広がっています。
通学型とオンライン型を組み合わせることで、子どもの状態や家庭の事情に合わせた柔軟な支援を受けられる点も大きなメリットです。

熊本県のフリースクール費用相場と助成金・補助金制度

こちらでは、熊本県内のフリースクールの費用相場と補助金などの制度についてまとめています。
熊本県内フリースクールの費用相場
熊本県内のフリースクールは、運営形態(民間・NPO・公立)によって費用が大きく異なります。
| 区分 | 授業料 (目安) |
|---|---|
| 民間・学校法人系 | 20,000円 〜 69,300円 |
| NPO・ボランティア団体 | 10,000円 〜 44,000円前後 |
| 行政(適応指導教室など) | 無料 |
1. 民間企業・学校法人系(学習サポート重視)
月額の目安: 20,000円 〜 69,300円前後
月額費用の幅が比較的大きい区分です。
通う日数やコース内容によって費用が変動します。
2. NPO・ボランティア団体系(居場所・交流重視)
10,000円 〜 44,000円前後
地域支援や非営利団体によって運営され、比較的費用を抑えた形で提供されているケースが見られます。
3. 行政・公的機関(適応指導教室など)
月額の目安: 無料
熊本県内の自治体が運営する支援スペースです。
利用にあたっては、在籍校との連携や一定の条件が設けられている場合があります。
熊本県内の補助金一覧【2026年最新】
熊本県におけるフリースクールの利用料負担をサポートする助成金情報を一覧にまとめました。
現時点では、熊本県全体としてフリースクールの利用料を一律に補助する制度は設けられていません。
一方で、熊本市を除く市町村を対象として、フリースクールの利用料に対し、前期・後期それぞれ20,000円を上限とする補助制度が設けられています。
このように、県全体で統一した支援制度はないものの、特定の対象区域に限って利用料補助が実施されている状況です。
(出典:https://www.pref.kumamoto.jp/soshiki/132/238984.html)
| 市町村 | 補助金・助成制度の有無 |
|---|---|
| 熊本市を除く市町村 | 利用料の補助 前期・後期20,000円(上限) |
※補助金・助成制度は年度途中で新設・変更・終了する場合があります。最新情報は必ず各自治体の公式サイトまたは担当窓口でご確認ください。
今後の展開について
近年、全国的にフリースクールへの公的支援を導入する自治体が増加しており、文部科学省も不登校児童生徒に対する多様な学びの場の確保を重視しています。
その方針を受け、各自治体ではフリースクール利用に対する助成制度や補助金制度の整備が進められています。
熊本県内では、県全域または多くの市町村でフリースクール利用に対する補助金・助成制度が整備されており、経済的負担を軽減しながら学びの選択肢を確保できる環境が整いつつあります。
自治体による支援制度があることで、フリースクールの利用を検討しやすくなり、保護者・子ども双方にとって安心して選択できる土台が形成されています。

熊本県における「出席扱い」の基準と手続き

文部科学省は、義務教育段階の不登校児童生徒が、学校外の公的機関や一定の条件を満たす民間施設において、相談・指導を継続的に受けている場合、その日数を指導要録上「出席扱い」とすることができると示しています。
対象となるかどうかは一律ではなく、保護者と学校が十分に連携し、当該支援が子どもの社会的自立や将来の円滑な学校復帰につながる内容であるかを、学校および教育委員会が確認したうえで、校長が最終的に判断します。
学習内容が学校の教育課程に照らして適切と認められる場合には、学習評価を行い指導要録へ記載することも可能とされています。
(出典:https://www.mext.go.jp/a_menu/shotou/seitoshidou/1422155_00004.htm)
出席扱いまでの流れ
実際の手続きは自治体や学校によって異なりますが、一般的には次のような流れで進むことが多いとされています。
- 担任の先生に相談・校内での検討
- 必要書類の提出・共有
- 校長による最終判断
※出席扱いの判断は一律ではなく「必ず認められる制度」ではありません。学校との丁寧な情報共有と、段階的な相談が重要になります。
出席扱いの実績は多くの市で確認されている
補助金制度は未整備ですが、フリースクールへの通学を学校の出席として認める「出席扱い」の実績は、熊本市、八代市、天草市、玉名市、荒尾市など、複数の市町村で確認されています。
これは文部科学省のガイドラインに基づくもので、保護者と学校が連携することで実現可能です。
出席扱いになることで、子どもの学習意欲の維持や進学時の配慮につながるため、経済的支援とは別の形での支援体制が一部で機能していると言えます。
熊本県内で出席扱い実績のあるフリースクール・家庭学習
熊本県内で出席扱い実績のあるフリースクール
トライ式中等部(熊本)
青山教室(熊本市)
八代市教育支援センター「くま川教室」(八代市)
カワセミ学級(天草市)
(※一部のみ記載しています)
出席扱い実績のあるオンラインフリースクール・教材
不登校のお子様向けに「完全1対1個別指導」キズキ共育塾
不登校専門オンライン個別指導「ティントル」
無学年式オンライン教材「すらら」
※掲載しているスクール以外でも、出席扱いとなる場合があります。
詳しくは各スクールへ直接お問い合わせください。

熊本県でお子さんに合った居場所を選ぶ3つのポイント

フリースクールや学びの場を選ぶとき、「どこを見て決めればいいの?」と迷われる保護者の方は少なくありません。
熊本県内には44校のフリースクールがありますが、それぞれに特徴があり、お子さんの状況や家庭の事情によって「合う・合わない」があります。
ここでは、熊本県で居場所を選ぶ際に特に重視したい3つのポイントをご紹介します。
①2〜3校を見学・体験してから決める
フリースクール選びで大切なのは、お子さん自身が「行きたい」と思える場所を見つけることです。
可能であれば2〜3校(オンラインも含む)を見学・体験し、実際の雰囲気や相性を比べてみましょう。
いくつかの選択肢を知ったうえで親子で納得して決めることが、安心して続けるための土台になります。
なぜ複数校の体験が必要なのか?
1校だけでは比較ができない
- 「ここしかない」と思い込んでしまいがち
- 他の選択肢を知らないまま決めてしまうリスク
お子さんの「本当に合う場所」が見えてくる
- A校では緊張していたけど、B校ではリラックスできた
- C校のプログラムの方が自分の興味に合っていた
- スタッフとの相性は実際に会わないとわからない
親子で納得して選べる
- 「ちゃんと比較して選んだ」という安心感
- 通い始めてから「やっぱり違った」を防げる
ひかりすまいるアドバイザー相性のいい先生と出会える可能性が上がります。
②通学距離とオンライン対応の有無
熊本県は都市部と阿蘇地域などの山間部で環境が大きく異なります。
豪雨や台風の影響を受けることもあり、移動に時間がかかる地域もあります。
確認すべきこと
自宅からの距離と所要時間
熊本市内へ通うのか、阿蘇・天草などからの移動になるのかで所要時間は大きく変わります。
電車・バスの本数や乗り換え、車での送迎の現実性まで具体的に確認しましょう。
通学頻度の柔軟性
週何日から通えるか、天候や体調に合わせた調整が可能かを確認します。
オンライン対応の有無
オンライン併用型であれば、悪天候時も学習を継続できます。
完全オンライン型のフリースクールも選択肢に入れると、居住地に関わらず質の高い支援を受けられます。
③費用と補助金の利用可否
フリースクールの月謝は施設によって大きく異なり、月額10,000円〜69,300円前後と幅があります。
継続して通うためには、無理のない費用設定であることが不可欠です。
確認すべきこと
月謝の内訳
入学金、月謝、教材費、施設利用費、イベント参加費など、何にいくらかかるのかを明確にしましょう。
無料または低額の選択肢
熊本県内には、市町村が運営する教育支援センター(適応指導教室)があり、基本的に無料で利用できます。
- 八代市教育支援センター「くま川教室」
- 山鹿市教育支援センター
- 菊池市教育支援センター
- 人吉市教育支援センター「かがやき教室」
- 各市町村の適応指導教室
など
補助金・助成制度の有無
現在、熊本県全体として一律の補助制度はありませんが、熊本市を除く市町村を対象に、フリースクール利用料への補助制度が設けられています。
制度は年度ごとに変更される可能性があるため、最新情報は必ず公式サイトや担当窓口で確認しましょう。
ひかりすまいるアドバイザーお子さんが安心して過ごせる環境かどうか、スタッフとの相性、プログラムの内容などを総合的に見て判断することが大切です。

熊本県の不登校・フリースクールに関する疑問を解決

こちらでは、熊本県にお住まいでフリースクールや不登校支援を検討されている方のよくある質問をまとめています。
まとめ|熊本県の不登校支援、まずは地域の情報を知ることから

最後にこの記事を振り返りましょう。
こちらの記事では、
- 熊本県全体の不登校支援の特徴と市町村別の詳細ページへの案内
- フリースクールの数や地域ごとの傾向
- 相談窓口・出席扱いの実績について
- 費用の目安、補助金・助成制度
について詳しくご紹介しました。
熊本県には、教育支援センターやフリースクールなど、学校以外にも子どもを支える選択肢があります。
地域によって支援の形や使える制度が異なるため、まずはお住まいの地域の詳細ページを確認してみてください。
気になる支援先や相談窓口があれば、無理のない範囲で問い合わせてみることが、お子さんに合った環境を見つける第一歩になります。

