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「毎月のフリースクール代がどれくらいなのか相場が知りたい」
「そもそも月額っていくらが普通なの？」
「補助金って、うちの自治体でも使えるのかな…」
フリースクールの費用は、通う日数やコース内容、運営形態によって幅があります。
オンライン中心や週1回程度のライトな利用なら月1万円前後から検討できる場合もあり、週3日以上の通学や個別支援が手厚いコースでは月3万〜5万円前後になることもあります。
東京都が令和6年に公表した調査でも、保護者が実際に支払っている月額や家計への負担感には大きな幅があることが報告されています。
ただ、運営形態や地域、利用するコースによって金額の幅が大きく、自治体の補助金制度も対象世帯やスクールごとに条件が異なるため、学費の全体像はつかみにくいですよね。
保護者の声子どもに合うフリースクールを探しているのですが、月謝の費用感や、利用できる補助金が知りたいです。
ひかりすまいるアドバイザーこの記事では、月額の目安・入会金・年間でかかる費用から、自治体別の補助金制度までまとめています。
この記事では、これまで全国のフリースクールを取材・調査してきたひかりすまいる編集部が、
- 月額の目安と内訳
- 入会金・年間でかかる費用の目安
- 自治体別の補助金・支援制度
- 費用を抑える3つの方法
などについて、2026年最新データでまとめています。
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【ひかりすまいる編集部】
全国47都道府県・792市町村を対象に、フリースクールや不登校支援制度の情報を調査・掲載しています。
- 対応エリア： 全国47都道府県・792市町村
- 掲載データ： 全国3,526校以上（支援教室・オンライン含む）
- 専門項目： 補助金申請 / 出席扱い制度 / 行政相談 / オンライン学習
各自治体・施設の公式情報をもとに、編集部が内容を確認・整理したうえで掲載しています。
フリースクールの費用は月額1〜5万円が相場
フリースクールの費用は、通う日数・コース内容・運営形態・地域によって大きな幅があります。
オンライン中心や週1回程度のライトな利用であれば月1万円前後から検討できる場合があり、週3日以上の通学型や個別支援が手厚いコースでは月3万〜5万円前後になるケースもあります。
お子さんに合うスクールを選ぶときは、料金だけでなく「通える日数」「サポート内容」「個別支援の有無」もあわせて確認しておくと安心です。
ここでは、公的調査データをもとに、運営形態別やコース別の費用感をわかりやすく見ていきましょう。
【最新】東京都調査では平均月額約4.5万円
東京都教育委員会が2024年8月に公表した「フリースクール等に通う不登校児童・生徒支援調査研究事業報告書」によると、保護者が実際に支払っている授業料の平均額は月額44,979円という結果が出ています。
さらに、この調査では回答した保護者の約6割が「家計への負担感がある」と回答しており、フリースクール費用が家計に与える影響の大きさが見て取れます。
※出典：東京都教育委員会「フリースクール等に通う不登校児童・生徒支援調査研究事業報告書【概要版】」（令和6年8月）
【全国】文部科学省調査では平均月額約3.3万円
少しデータは古くなりますが、文部科学省が全国規模で実施した調査では、フリースクールの月額費用の全国平均は33,000円です（文部科学省2015年調査）。
月会費の分布は以下の通りです。
| 月会費 | 割合 |
|---|---|
| 1〜3万円 | 38.2%（最多） |
| 3〜5万円 | 36.3% |
| 5万円超 | 10.3% |
| 5,000円以下 | 9.5% |
1〜5万円の価格帯で全体の約75%を占めており、「月額3〜5万円」が相場といえる根拠になっています。
※出典：文部科学省「小・中学校に通っていない義務教育段階の子供が通う民間の団体・施設に関する調査」（2015年）
運営形態で費用はここまで違う
運営形態によって、月額の値段には大きな差があります。お子さんに合うタイプを選ぶときは、費用感や金額もあわせてチェックしておくと安心です。
| 月額 | 主な運営形態 |
|---|---|
| 1〜2万円 | オンライン型・NPO運営の低価格帯 |
| 3〜5万円 | 一般的な通所型(最も多い価格帯) |
| 6〜10万円 | 少人数制・専門プログラム |
| 10万円超 | 全寮制・特化型(英語イマージョン等) |
月謝以外にかかる費用もチェック
フリースクールの費用を考えるとき、月謝だけに目が行きがちですが、実際には以下のような費用も発生します。
- 入会金：0円〜10万円と幅がある
- 教材費：月数千円〜1万円
- イベント費・遠足費：都度徴収
- 年会費：施設によって必要
内訳の詳細は、このあと詳しく解説していきますね。
フリースクールの費用の内訳｜授業料・教材費・施設費まで
フリースクールの費用は、月謝だけではありません。
入会時にまとまった金額が必要になったり、月謝とは別に教材費やイベント費が発生したりと、項目ごとに費用が分かれているケースが多く見られます。
「月謝は3万円だと思っていたのに、実際に払う金額はもっと多かった…」とならないためにも、費用の内訳はあらかじめ把握しておくと安心です。
ここでは、フリースクールでかかる主な費用を一つずつ解説していきますね。
授業料（月謝・学費）｜平均は月額1〜5万円
フリースクールの費用の中で、もっとも大きな割合を占めるのが授業料（月謝・学費）です。
授業料は、通う日数・コース内容・運営形態によって幅があり、スクールごとに金額が異なります。
公的調査では、文部科学省の全国調査（平成27年）で月会費の平均が約3万3,000円、東京都教育委員会の調査（令和6年）で保護者が実際に支払っている平均額が月額44,979円と報告されています※。
ただし、これらは全体の平均であり、お子さんの通う日数やコース内容によって、実際の授業料は変わります。
- 学習支援・カウンセリング込みの一律料金
- 通う日数（週1日・週3日・週5日）で変動する料金
- 時間制・コマ制で細かく分かれている料金
週に何日通うかや、含まれる支援内容によって料金が変わるスクールも多いため、お子さんの通学ペースに合った料金プランがあるかを、あわせて確認しておくと安心ですよ。
出典：文部科学省「小・中学校に通っていない義務教育段階の子供が通う民間の団体・施設に関する調査」（平成27年）
出典：東京都教育委員会「フリースクール等に通う不登校児童・生徒支援調査研究事業報告書【概要版】」（令和6年8月）
教材費｜年間1〜2万円が目安
学習支援を行うフリースクールでは、教材費が別途必要になるケースがあります。
年間1〜2万円程度で固定されているスクールもあれば、使った分だけ実費で徴収されるスクールもあります。
教材費の目安
年間固定：12,000円前後が多い
実費徴収：使用するテキストやプリント代ごと
教材費なし：手作りプリントや無料教材を使用するスクール
ひかりすまいるアドバイザーお子さんが学習に力を入れたいタイプか、活動や体験を中心にしたいタイプかによっても、教材費の負担は変わってきますよ。
施設費・設備費｜月額数千円〜
施設の維持費や光熱費として、施設費や設備費が発生するスクールもあります。
月額数千円〜1万円程度が一般的ですが、全寮制フリースクールの場合は、寮の管理費や食費が含まれるため、月額15〜30万円と高額になるケースもあります。
通所型と全寮制で、この項目は大きく異なる部分です。
イベント費・遠足費｜都度徴収が基本
フリースクールでは、季節のイベントや遠足、宿泊体験などを行うところが多くあります。
こうした活動に参加する際は、都度費用が発生します。
- お食事会・季節のイベント：500〜3,000円程度
- 日帰り遠足・体験活動：3,000〜10,000円程度
- 宿泊を伴うイベント：10,000〜50,000円程度
ひかりすまいるアドバイザー必須参加ではなく希望者のみのスクールも多いため、費用と相談しながら参加できる場合がほとんどです。
年会費・諸経費｜スクールによって有無あり
スクールによっては、年会費や諸経費が設定されている場合もあります。
- 年会費：年間1〜3万円程度
- 保険料：年間数千円（傷害保険など）
- 冷暖房費：季節ごとに数千円
費用の総額を把握するためにも、見学や体験の際に「月謝以外にかかる費用はありますか？」と具体的に質問しておくと安心ですよ。
フリースクール費用を抑える3つの方法
フリースクールに通わせたいけれど、毎月の費用が家計への負担になる…と感じるご家庭も少なくありません。
ひかりすまいるアドバイザー費用負担をやわらげるには、補助金の活用だけでなく、スクール選びの段階で工夫できるポイントもあります。
ここでは、フリースクール費用を抑える具体的な3つの方法を紹介していきますね。
方法①：オンラインフリースクールを選ぶ
費用を抑えたい場合、オンラインフリースクールを選ぶことも有力な選択肢のひとつです。
通学型に比べて施設の維持費がかからない分、料金がおさえめに設定されているスクールも多く見られます。
オンライン中心や週1回程度のライトな利用であれば、月1万円前後から検討できる場合もあります。
ただし、利用できるサポート内容や日数はスクールによって幅があるため、料金だけでなく、どこまで支援してもらえるかをあわせて確認しておくと安心です。
オンラインフリースクールの費用が安い理由
- 施設の維持費・光熱費がかからない
- 全国どこからでも参加できるため、スクール選びの選択肢が広い
- 少人数制でも運営コストを抑えやすい
オンラインフリースクールのメリット
- 自宅から参加できるため、通学の負担がない
- 学習支援・居場所支援・体験活動など、スクールによってさまざまなサポートを受けられる
- 出席扱い認定に対応しているスクールも増えている（※小・中学校が対象）
「通所型に通わせたいけれど、費用が厳しい」「近くにフリースクールがない」というご家庭にとって、オンラインフリースクールは現実的な選択肢になっています。
方法②：自治体の補助金・助成金を活用する
お住まいの自治体に補助金制度がある場合、月額1〜4万円の支援が受けられます。
補助金を使うと、月額5万円のフリースクール費用が実質2〜4万円になるケースもあり、家計への負担が大きく変わってきます。
補助金活用のポイント
- 県と市区町村の両方の制度を確認する（上乗せで受けられる地域もある）
- 入会前に制度の対象施設かを確認する
- 領収書・在籍証明などの書類は必ず保管する
- 申請期限を逃さないようカレンダーに登録する
ひかりすまいるアドバイザー補助金制度はまだまだ知られていないケースも多く、「知らなかったから申請していなかった」というご家庭も少なくありません。
お住まいの自治体の制度は、>>【2026年最新】全国792市町村のフリースクール補助金一覧 から確認できます。
方法③：自治体の教育支援センター（適応指導教室）と併用する
費用を抑えたいなら、自治体が運営する教育支援センター（適応指導教室）と併用する方法もあります。
教育支援センターは、自治体が不登校のお子さんのために設置している公的施設で、費用がかからず、学校の出席扱いになる施設です。
教育支援センター＋フリースクールの併用イメージ
平日は教育支援センター（無料）に通う 週1〜2回だけフリースクールを利用する
フリースクールでは、教育支援センターにはない体験活動やカウンセリングを受ける
この方法であれば、フリースクールの利用日数を減らせるため、月謝も利用回数に応じた金額に抑えられるケースがあります。
ひかりすまいるアドバイザーただし、教育支援センターはお子さんとの相性もあるため、見学・体験を通してお子さんに合う場所を見つけることが大切です。
フリースクール費用の補助金・支援制度【自治体別】
フリースクールの費用負担を軽減できる補助金・助成金制度が、全国の自治体で少しずつ広がってきています。
「フリースクールに通わせたいけれど、費用が心配…」というご家庭にとって、自治体の補助金は大きな支えになります。
ひかりすまいるアドバイザーここでは、補助金制度の全体像と、主な支援内容をご紹介していきますね。
補助金は「県単位」と「市区町村単位」の2種類がある
フリースクールの補助金制度は、国が一律で行っているものではなく、県や市区町村が独自に実施しています。
そのため、お住まいの地域に制度があるかどうかをまず確認することが、費用を抑える第一歩になります。
補助金制度は、大きく分けて2種類あります。
- 県単位で一律実施：東京都・茨城県・山梨県・三重県・富山県
- 市区町村ごとに独自実施：全国の多数の自治体
県と市区町村の両方に制度がある地域では、合算して月額3万円以上の補助が受けられるケースもあります。
県単位で補助金制度がある地域
県単位でフリースクール補助金を実施している主な地域は以下の通りです。
| 県 | 助成額 | 主な対象条件 |
|---|---|---|
| 東京都 | 月額2万円（上限） | 所得制限なし |
| 茨城県 | 月額1.5万円（授業料の1/2以内） | 経済的事情のある世帯 |
| 山梨県 | 月額1.5万円 | 就学援助世帯 |
| 三重県 | 月額1.5万円 | 生活保護・就学援助・非課税世帯など |
| 富山県 | 利用料等の補助 | 県内在住の通所児童生徒 |
特に東京都は所得制限がないため、幅広いご家庭が対象になりやすい点が特徴です。
【注目】市区町村で手厚い支援を行う地域も
市区町村単位では、月額4万円までの手厚い支援を行う自治体もあります。
| 自治体 | 助成額 |
|---|---|
| 滋賀県の多くの自治体（草津市・東近江市・彦根市・近江八幡市・守山市など） | 月額4万円（上限） |
| 愛知県名古屋市 | 月額3万円（上限） ※2026年度開始予定 |
| 愛知県豊田市・大府市 | 月額2万円（上限） |
| 神奈川県相模原市 | 月額2万円（上限） |
| 千葉県市原市 | 月額2万円（上限） |
| 神奈川県鎌倉市 | 月額1万円（利用料の1/3） |
ここに注意！
自治体ごとに支給額・対象条件・申請方法が異なるため、詳細はお住まいの市区町村のホームページか、直接問い合わせて確認するのが確実です。
補助金以外にも使える支援制度
補助金・助成金のほかにも、フリースクール費用の負担を軽減する方法はいくつかあります。
自治体の教育支援センター（適応指導教室）の活用：費用がかからない公的施設
フリースクール独自の減免制度：経済的事情による月謝の減額
兄弟割引・ひとり親割引：一部のスクールで実施
特に自治体が運営する教育支援センター（適応指導教室）は、費用がかからず、出席扱いにもなる選択肢として、あわせて検討する価値があります。
補助金を活用する際の注意点
- 申請期限があるため、入会前に制度を確認しておく
- 対象となるフリースクールの条件（出席扱い施設など）がある場合が多い
- 入会金・教材費は助成対象外のケースが多い
- 申請書類・領収書の保管が必要
申請手続きはやや煩雑に感じられるかもしれませんが、年間で数十万円単位の支援を受けられる可能性もあるため、ぜひ活用を検討してみてくださいね。
お住まいの地域の補助金制度を詳しく調べる
ここで紹介したのは、全国の補助金制度の一部です。
ひかりすまいるでは、全国792市町村を独自調査し、各地域の補助金・助成制度の有無や金額、申請方法を一覧にまとめています。
お住まいの地域で使える制度を調べたい方は、以下のページからご確認ください。
フリースクールの費用はなぜ高い？安いスクールとの違い
フリースクールの費用を調べていると、「なぜこんなに高いの？」「公立学校は無料なのに、どうして月数万円もかかるの？」と感じる方も多いのではないでしょうか。
同じフリースクールでも、月額1万円台のところもあれば、月額20万円を超えるところもあります。
ここでは、フリースクールの費用が高くなる理由と、スクールごとに価格差が生まれる背景を解説していきますね。
フリースクールが公立学校より高い理由
フリースクールが公立学校より高額になるのは、運営の仕組みが根本的に違うからです。
- 公立学校：税金で運営されているため、授業料が無料または低額
- フリースクール：民間の運営のため、運営費をすべて利用者の費用でまかなう必要がある
ひかりすまいるアドバイザーフリースクールは、文部科学省が定める「学校」には該当しません。
そのため、国や自治体からの運営補助が限られており、スタッフの人件費・施設の維持費・教材費などを、基本的には利用者からの費用でまかなう必要があります。
また、フリースクールは少人数制で手厚いサポートを提供するスクールが多く、スタッフ1人あたりが見る子どもの数が少ないため、その分費用が高くなる傾向があります。
スクールによって費用に差が出る5つの理由
同じフリースクールでも、月額1万円台から20万円超まで、費用には大きな差があります。
費用差が生まれる主な理由は、以下の5つです。
- 運営形態（通所型・オンライン型・全寮制）
- スタッフの人数・専門性
- 施設の規模・設備
- 地域（都市部・地方）
- 提供するサービスの内容
一つずつ解説していきます。
①運営形態｜オンライン型は通所型の半分以下
月額の値段や金額にもっとも大きな差が出るのが、運営形態の違いです。
| 運営形態 | 月額の目安 |
|---|---|
| オンライン型 | 1〜3万円 |
| 通所型 | 1〜5万円 コースや通う回数により幅あり |
| 少人数制・専門プログラム | 6〜10万円 |
| 全寮制 | 15〜30万円 |
オンライン型は、施設の維持費や光熱費がかからない分、費用を大きく抑えられます。
通所型の半分以下の費用で利用できるスクールも多く、「費用は抑えたいけれど、サポートは受けたい」というご家庭に選ばれやすい選択肢です。
ひかりすまいるアドバイザー全寮制は、24時間体制のサポートと食費・寮費が含まれるため、もっとも高額になる傾向があります。
②スタッフの人数・専門性
スタッフの人数や専門性によっても、費用は大きく変わります。
ボランティアスタッフ中心のNPO運営：費用を抑えられる
臨床心理士・公認心理師などの専門家が常駐：費用は高め
お子さんに発達の特性がある、カウンセリングをしっかり受けたい、などの希望がある場合は、専門スタッフの有無を確認しつつ、費用との兼ね合いを見ていくことが大切です。
③施設の規模・設備
施設の規模や設備が充実しているスクールほど、費用は高くなる傾向があります。
フリースクールの運営場所は、民家の一部屋を活用しているところもあれば、ビルの一室を借りているスクール、複数のフロアや教室を使って運営しているスクールなど、さまざまです。
借りている広さや立地、設備の内容によって賃料や光熱費、維持費が変わるため、それが施設費や月謝に反映されることがあります。
また、プログラミング学習などに力を入れているスクールでは、パソコンや機材を揃えている分、費用が高くなる場合もあります。
見学や資料請求の際は、月額料金とあわせて入会金や施設費の有無も確認しておくと安心です。
④地域｜都市部は費用が高くなりやすい
同じタイプのフリースクールでも、地域によって費用差があります。
都市部（東京・大阪・名古屋など）：家賃・人件費が高いため、費用も高め
地方：費用を抑えやすい傾向
ただし、地方はスクールの選択肢が少なく、通える範囲に希望のスクールが少ないというケースもあります。
ひかりすまいるアドバイザーこの場合、オンライン型を検討するご家庭も増えてきています。
⑤提供するサービスの内容
スクールによって、費用に含まれるサービスの内容はさまざまです。
学習支援のみ：費用は抑えめ
学習支援＋カウンセリング：費用は標準
学習支援＋カウンセリング＋体験活動＋進路相談：費用は高め
ただし、「月謝が高い＝合うスクール」とは限りません。
ひかりすまいるアドバイザーお子さんにとって必要なサポートが含まれているかどうかを基準に、費用の妥当性を判断していきましょう。
安いスクールを選ぶときの注意点
費用の安いスクールを選ぶ際は、以下の点を確認しておくと安心です。
- 月謝以外の費用が別途発生しないか（教材費・施設費・年会費など）
- スタッフの人数が十分か、安全な体制が整っているか
- お子さんに合う雰囲気・プログラムか 出席扱い制度に対応しているか
ひかりすまいるアドバイザー費用だけで判断せず、お子さんに合う環境かどうかを最優先に選ぶことが、結果的に長く通える選択につながりますよ。
フリースクールの費用に関するよくある質問（FAQ）
最後に、フリースクールの費用についてよくいただく質問をまとめました。
- フリースクールは公立学校みたいに無料にならないの？
-
フリースクールは文部科学省が定める「学校」ではなく民間の施設のため、運営費を利用者の費用でまかなう必要があり、基本的に無料にはなりません。
ただし、自治体の補助金を使えば、月額1〜4万円の支援が受けられる場合があります。
- フリースクールの費用は、月謝だけで足りますか？
-
月謝以外にも、入会金・教材費・施設費・イベント費・年会費などが発生するケースがあります。
見学や体験の際に「月謝以外にかかる費用はありますか？」と質問して、全体の費用を把握しておくと安心です。
- 補助金は誰でも受けられますか？
-
自治体によって条件が異なります。
東京都のように所得制限なしの制度もあれば、就学援助世帯や生活保護世帯のみを対象とする制度もあります。
また、ほとんどの補助金で「出席扱い認定を受けているスクール」であることが条件になっています。
- フリースクール費用を安く抑える方法はありますか？
-
もっとも効果的なのは、オンラインフリースクールを選ぶ方法です。
通所型の半額以下（月額1〜3万円）で利用できるスクールが多くあります。
そのほか、自治体の補助金の活用や、教育支援センター（適応指導教室・無料）との併用もおすすめです。
- 兄弟で通う場合の割引はありますか？
-
スクールによっては、兄弟割引を設けているところがあります。
月謝の10〜30%割引になるケースが多いため、兄弟で通うことを検討している場合は、見学時に直接確認してみてください。
まとめ
最後にこちらの記事をまとめていきましょう。
こちらの記事では、
- フリースクール費用の月額相場と内訳
- フリースクール費用を抑える3つの方法
- 自治体別の補助金・助成制度
- 費用がスクールごとに違う理由
などについてご紹介しました。
月額費用 1万円〜5万円程度（東京都の最新調査では平均44,979円）
※通うコースや回数による
初期費用の目安 10万円〜20万円程度
対象年齢 小学生〜高校生
※※費用・対応内容はスクールによって異なります。最新情報は各スクールの公式サイトでご確認ください。
フリースクールの費用は、お子さんに合う環境を選ぶうえで気になるポイントではありますが、自治体の補助金制度やオンラインフリースクールなど、負担を抑える選択肢は少しずつ広がっています。
「費用が高いから無理かも…」と諦める前に、まずはお住まいの地域の補助金制度を確認したり、気になるスクールに資料請求や見学を申し込んでみることから始めてみましょう。
見学や体験を受け付けているスクールも多いので、実際の雰囲気を親子で確かめながら、無理のない範囲で選ぶことが大切です。
費用だけで判断せず、お子さんに合う場所かどうかを大切にしながら、焦らず見つけていきましょう。
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